Cюжет игры Сталкер Зов Припяти происходит после окончания событий нашумевшей игры stalker (сталкер) получив сведения о том что открывается дорога к центру зоны правительство приходит к решению провести военную спец операцию по быстрому взятию ЧАЭС под свой непосредственный контроль. Операция получила кодовое название фарватер. Следуя плану этой операции группа военных специалистов должна направиться чтобы разведать воздушную территорию для того чтобы составить план расположения аномальных полей после разведки по специальным безопасным путям выдвинутся уже основные силы спецназа. Несмотря на то что была очень тщательная подготовка операция терпит провал большинство вертолетов из ударной группы почему-то разбивается.С целью сбора информации о причинах такого провала операции служба безопасности из Украины направляет своего спец агента в центр зоны отчуждения дальше все зависит от вас.
